Ninjar.io oynamaya hemen başlamak için oyunda kullanacağınız karaktere bir isim verip enter tuşuna basın. Bu sayede oyuna başlayacak, ninjalara karşı savaşacaksınız. Oyundaki amacınız diğer, düşman olan ninjaları yok etmek ve tecrübe puanı kazanarak seviye atlamak.